Вчені з Університету Британської Колумбії виявили «слабке місце» у всіх основних варіантах вірусу SARS-CoV-2, повідомляє Nature Communications. Ця вразливість, яка також спостерігалася в нещодавно розроблених підваріантах омікрон BA.1 і BA.2, є структурним компонентом вірусу, який «значною мірою не змінюється в усіх варіантах і може бути легко нейтралізований фрагментом антитіла». – Перед нами відкрилися абсолютно нові можливості лікування, – сказав доктор Шрірам Субраманіам, керівник дослідницької групи.
Цю слабкість потенційно можна використати шляхом нейтралізації антитіл, прокладаючи шлях для лікування, ефективного проти всіх варіантів коронавірусу. Команда під керівництвом Dr. Шрірама Субраманіама використовував кріоелектронну мікроскопію (кріо-ЕМ), щоб виявити на атомному рівні структуру чутливої ділянки білка вірусного шипа. Цей фрагмент називають епітопом. Тоді ж вчені описали антитіло VH Ab6, фрагмент якого здатний прикріплюватися до епітопу вірусу і повністю його нейтралізувати.
SARS-CoV-2 — це високоадаптивний вірус, який еволюціонував, щоб уникнути більшості існуючих методів лікування антитілами, а також більшої частини імунітету, який забезпечують вакцини та природні інфекції, сказав доктор Субраманіам. «Наше дослідження виявило слабкість, яка практично не змінюється в усіх варіантах і може бути легко нейтралізована фрагментом антитіла», — додав він.
«Це хороша основа для розробки різноманітних терапій і методів лікування, які потенційно можуть допомогти багатьом людям із групи ризику», — підкреслив він.
«Перед нами відкрилися абсолютно нові можливості лікування»
Антитіла — це молекули, які природним чином виробляє наш організм для боротьби з інфекцією, але їх також можна виробити в лабораторії та надати пацієнтам пізніше. Хоча вже розроблено кілька методів лікування антитілами проти COVID-19, їхня ефективність завжди різко знижувалася перед лицем нових, сильно мутованих варіантів, таких як омікрон.
– Антитіла приєднуються до вірусу дуже специфічним чином. Підганяють його, як ключ до замка. Отже, коли вірус мутує, ключ більше не збігається, пояснив Субраманіам. – Тож ми шукали універсальні ключі. Антитіла, які нейтралізують вірус навіть після великих мутацій, додав він.
Таким універсальним ключем, ідентифікованим в описаному дослідженні, виявився фрагмент антитіла VH Ab6. Експерименти підтвердили його ефективність проти варіантів альфа, бета, гамма, дельта, каппа, епсилон і омікрон. Фрагмент нейтралізує SARS-CoV-2, приєднуючись до епітопу спайкового білка та блокуючи вірусу проникнення в клітини людини.
– Епітоп, який ми описуємо в цій публікації, не охоплюється т. зв гарячих точок мутації, тому він зберігається в дуже схожому або незмінному вигляді в різних варіантах, – сказав автор дослідження. – Тепер, коли нам вдалося детально описати його структуру, перед нами відкрилися абсолютно нові можливості лікування, – підкреслив він.
“Ахіллесова п’ята” коронавірусу
За словами доктора Субраманіам, ця специфічна «ахіллесова п’ята» вірусу, може бути використана виробниками ліків не тільки для створення ефективних заходів проти домінуючих зараз варіантів, а й проти тих, що з’являться через деякий час.
– Ми отримали повну картину цього чутливого місця. Ми знаємо кожну взаємодію спайкового білка з антитілом у цій самій області. Таким чином, ми можемо розробити масу різних методів лікування антитілами, підсумував Субраманіам. «І наявність широко ефективних, багатоваріантних препаратів повністю змінила б правила гри в умовах пандемії», — додав він.
Основне джерело фото: Shutterstock